Les entérovirus humains peuvent être détectés dans les boues d'épuration provenant des stations d'épuration et dans les sédiments marins. Vous trouverez ci-dessous un aperçu des quatre virus les plus courants présents dans l'eau.
I. Entérovirus
Les entérovirus appartiennent à la famille des Picomaviridae, qui comprend le poliovirus, le virus Coxsackie A, le virus Coxsackie B et le virus orphelin cytopathogène entérique humain (ECHOvirus).Les entérovirus sont les virus les plus répandus dans les milieux aquatiques et les plus étudiés en virologie aquatique. Ils sont souvent utilisés comme agents pathogènes représentatifs pour évaluer la sécurité virale de l'eau en raison de plusieurs caractéristiques clés : taux élevés d'excrétion virale et périodes d'excrétion prolongées chez les personnes infectées ; forte résistance à l'environnement et durée de survie prolongée ; potentiel de transmission par des voies autres que l'eau ; et relative facilité de détection par rapport à d'autres virus.
Les entérovirus partagent les caractéristiques suivantes : ① Les virions sont sphériques avec une symétrie icosaédrique, mesurent 22 à 39 nm de diamètre et ne possèdent pas d'enveloppe ; ② L'acide nucléique est constitué d'ARN simple brin à polarité positive ; ③ Les entérovirus présentent une résistance à l'éther et aux acides (pH 3-5), ainsi qu'à la bile et aux désinfectants courants tels que l'alcool à 70 % et le lysol à 5 % ;Ils sont sensibles aux agents oxydants tels que le permanganate de potassium à 1 %, le peroxyde d'hydrogène à 1 % et les désinfectants à base de chlore. De plus, ils sont vulnérables aux températures élevées, à la dessiccation et aux rayons ultraviolets ; une exposition à 56 °C pendant 30 minutes inactive le virus. Les virus peuvent persister dans les matières fécales et les eaux usées pendant plusieurs mois ; ④ Tous peuvent se répliquer dans le tractus intestinal et envahir la circulation sanguine pour provoquer une virémie, entraînant divers syndromes cliniques.
1. Virus de la poliomyélite
Ce virus est un virus sphérique minuscule mesurant 8 à 30 nm de diamètre, appartenant au genre des entérovirus. La poliomyélite est une maladie infectieuse aiguë. L'infection se manifeste souvent par de la fièvre et des douleurs dans les membres, les lésions primaires affectant le système nerveux. Par conséquent, certains patients peuvent développer une paralysie, et les cas graves peuvent entraîner une paralysie résiduelle.La maladie touche principalement les enfants, d'où son autre nom, paralysie infantile.
Les personnes infectées excrètent le virus par les sécrétions nasopharyngées et les matières fécales. Les aliments et l'eau peuvent être contaminés par transmission fécale, ce qui fait de l'ingestion orale la principale voie d'infection. Les sources d'eau contaminées peuvent faciliter l'apparition d'épidémies importantes.
Le virus présente une forte viabilité en dehors du corps humain, survivant pendant des mois dans l'eau et les matières fécales. Il persiste pendant de longues périodes à basse température, mais est sensible à la chaleur et à la sécheresse. Un chauffage à 60 °C ou une exposition aux rayons ultraviolets l'inactive en 0,5 à 1 heure. Divers agents chlorés, la teinture d'iode à 2 %, le formaldéhyde et le chlorure mercurique possèdent tous des propriétés désinfectantes.Une désinfection au chlore résiduel à 0,3-0,5 mg/L pendant une heure de contact peut inactiver ce virus.
2. Autres entérovirus
Outre le poliovirus, les entérovirus comprennent le Coxsackie et l'Echovirus. Ces deux virus sont également répandus dans le monde entier et touchent principalement les enfants.Ils circulent généralement plus facilement pendant l'été et l'automne. Les deux virus ont pour caractéristique de coloniser de manière transitoire le tractus intestinal humain. Ces virus sont relativement petits, généralement moins de 30 nm de diamètre, et possèdent une résistance considérable, pouvant résister à l'éther diéthylique, à l'éthanol à 70 % et à une solution de savon au goudron de houille à 5 %. Cependant, ils sont très sensibles aux agents oxydants.
Les manifestations cliniques induites par ces virus sont complexes et variables. Des virus du même sérotype peuvent provoquer des syndromes différents, tandis que des virus de sérotypes différents peuvent produire des manifestations cliniques similaires. Les symptômes courants comprennent : méningite aseptique, encéphalite, myocardite et péricardite aiguës, pleurodynie épidémique, pharyngite herpétique, maladies exanthématiques, infections respiratoires et diarrhée pédiatrique.
II. Virus de l'hépatite
L'hépatite virale est généralement classée en hépatite A (hépatite infectieuse ou hépatite à courte période d'incubation) et hépatite B (hépatite sérique ou hépatite à période d'incubation), présentant des changements pathologiques et des manifestations cliniques largement identiques.Les principaux symptômes cliniques comprennent une perte d'appétit, des nausées, une gêne abdominale haute (ou une douleur dans la région hépatique) et de la fatigue. Certains patients développent une jaunisse et de la fièvre, la plupart présentant une hépatomégalie accompagnée d'une altération de la fonction hépatique.
Le virus de l'hépatite A (VHA) est un picornavirus qui présente des différences morphologiques significatives par rapport aux autres membres de son genre. Classé comme entérovirus de type 72 en 1981, il a récemment été reclassé dans la famille des Hepamavirus en raison de ses caractéristiques distinctes des entérovirus à de nombreux égards.
Le VHA est principalement excrété dans les selles et transmis par voie orale. Des épidémies peuvent survenir à la suite d'une contamination des sources d'eau ou des réserves alimentaires.
Le virus de l'hépatite présente une forte résistance aux désinfectants chimiques courants, survivant pendant des mois ou des années dans des conditions sèches ou gelées. Son inactivation nécessite une irradiation aux ultraviolets pendant 1 heure ou une ébullition pendant plus de 30 minutes. La désinfection au chlore présente un certain effet inactivant.
III. Rotavirus
Le rotavirus appartient au genre Rotavirus de la famille des Reoviridae. Il a été isolé pour la première fois à partir de cellules épithéliales duodénales de patients souffrant de diarrhée par Bishop et al. en Australie en 1973. La particule virale est sphérique et possède une capside à double couche, chaque couche formant un icosaèdre.Les particules de la capside interne sont disposées radialement le long de la périphérie virale, ressemblant aux rayons d'une roue. Le virus intact mesure environ 70 à 75 nm, tandis que les particules rugueuses dépourvues de capside externe ont une taille de 50 à 60 nm. Seul le virus à double capside est infectieux.
Le rotavirus est l'une des causes les plus fréquentes de diarrhée aiguë chez les enfants dans le monde. On estime que plus de 140 millions d'enfants dans le monde contractent chaque année une gastro-entérite à rotavirus, entraînant des centaines de milliers de décès. Son incidence maximale se produit principalement en automne et en hiver, d'où son nom commun de « diarrhée d'automne ».
Le rotavirus présente une résistance considérable à divers facteurs physiques et chimiques, persistant dans les matières fécales pendant des jours, voire des mois.Le virus conserve son infectiosité après un traitement à l'éther, au chloroforme, à des cycles répétés de congélation-décongélation, à des ultrasons, à une incubation à 37 °C pendant 1 heure ou à température ambiante (25 °C) pendant 24 heures. Il résiste aux acides et aux alcalis, conservant son infectiosité dans une plage de pH comprise entre 3,5 et 10,0. L'éthanol à 95 % est le plus efficace pour l'inactiver, tout comme un chauffage à 56 °C pendant 30 minutes.
Le rotavirus se transmet principalement par voie fécale-orale, se propageant par l'ingestion d'eau ou d'aliments contaminés, ou par contact avec des objets contaminés. Une épidémie survenue dans le Colorado, aux États-Unis, en 1981, a été liée à la contamination de l'approvisionnement municipal en eau. Depuis 1982, la Chine a connu plusieurs épidémies à grande échelle de rotavirus du groupe B touchant des centaines de personnes, causées par la contamination des eaux usées de l'eau potable.
IV. Coronavirus du SRAS (SARS-CoV)
Le premier cas de syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS, communément appelé pneumonie atypique) a été identifié dans la province du Guangdong, en Chine, à la fin de l'année 2002. En juin 2003, le SRAS s'était propagé dans 380 pays et régions, avec plus de 8 000 cas confirmés et plus de 800 décès.Les premiers symptômes comprenaient généralement une fièvre supérieure à 38 °C accompagnée de frissons, ou des maux de tête, de la fatigue et des myalgies. Les stades ultérieurs se manifestaient par une toux sèche sans mucosités et une détresse respiratoire. La transmission se faisait principalement par la propagation de gouttelettes à courte distance, mais le contact avec les sécrétions respiratoires par les mains, suivi d'une exposition à la bouche, au nez ou aux yeux, facilitait également la transmission.
Les recherches actuelles identifient l'agent pathogène du SRAS comme étant le coronavirus du SRAS, classé dans l'ordre des Nidovirales et la famille des Coronaviridae, appartenant au groupe des virus à ARN simple brin. Le virus mesure 80 à 140 nm de diamètre.
Plus de 100 types de virus détectés dans les eaux usées non traitées ont été identifiés dans les matières fécales humaines.Chaque gramme de matières fécales humaines peut contenir plus d'un million de virus, tandis que les particules virales infectieuses présentes dans les eaux usées peuvent atteindre des concentrations allant jusqu'à 500 000 par litre. Ces virus sont à l'origine de la transmission des maladies. Pour réduire les taux d'incidence, il faut non seulement prêter attention à l'hygiène personnelle et à la sécurité alimentaire, mais aussi, et surtout, s'attaquer à la source en purifiant les plans d'eau et en réduisant au minimum le rejet des eaux usées domestiques et industrielles dans les sources d'eau.