Cystit är en vanlig urinvägsinfektion som står för cirka 50–70 % av alla urinvägsinfektioner. Den är vanligare hos kvinnor på grund av deras kortare urinrör och närhet till anus, vilket gör dem mer mottagliga för E. coli-infektioner. De vanligaste symtomen på cystit är frekvent urinering, trängningar och smärtsam urinering. Under antibiotikabehandling kan patienter också ha nytta av att dricka bakpulvervatten för att påskynda återhämtningen.
Konsumtion av bikarbonatvatten alkaliserar urinen, eftersom bikarbonat omvandlas till CO₂ och H₂O i kroppen. Detta minskar vätejonkoncentrationen i kroppsvätskorna, vilket minskar irritationen i urinvägarna. Det kan hjälpa till att lindra besvär som frekvent urinering, trängningar och smärta.Dessutom hämmar alkaliserande urin bakterietillväxt. Escherichia coli, den vanligaste patogenen som orsakar cystit, förökar sig snabbt i sura miljöer. Alkalisk urin hämmar effektivt dess tillväxt.Dessutom ökar alkaliserad urin effekten av antimikrobiella läkemedel samtidigt som biverkningarna minskar. Till exempel bildar sulfonamidläkemedel lätt kristaller i sur urin, vilket skadar njurkanalerna och urinvägarnas epitelceller. Detta kan leda till kristalluri, hematuri och smärta i sidan, och i svåra fall orsaka oliguri, dysuri eller till och med uremi.
Vid urinvägsbesvär kan cystitpatienter lösa upp 1 gram natriumbikarbonat i 500 ml vatten och dricka det. Därefter ger det goda resultat att dricka 250 ml av denna lösning varje timme under de följande åtta timmarna.