De eksakte årsakene til ektopisk graviditet er fortsatt uklare, men den viktigste bidragende faktoren er sannsynligvis abnormiteter i egglederne.
Pasienter med en historie med kronisk salpingitt, blindtarmbetennelse, bekken tuberkulose, peritonitt eller endometriose kan utvikle sammenvoksninger, innsnevringer eller delvise blokkeringer i egglederne, noe som øker risikoen for ektopisk graviditet.I tillegg kan underutviklede eggleder hindre normal utvikling av det befruktede egget. Medfødte misdannelser som tubal divertikula eller accessoriske fimbriae kan også bidra til ektopisk graviditet.
Der hvor egglederavvik ikke er årsaken, kan ektopisk graviditet skyldes et vandrende befruktet egg. Etter befruktning i den ene egglederen kan det befruktede egget vandre gjennom livmorhulen til den motsatte egglederen, implantere seg der eller vandre rundt i bukhulen. Langvarig vandring gjør at det utviklende embryoet kan vokse, noe som potensielt kan føre til eggledergraviditet. Svikt i prevensjon er en annen medvirkende faktor.
Mange kvinner bruker nå intrauterine enheter (IUD) som prevensjon, ofte referert til som å ha en «IUD satt inn». Hvis prevensjonen svikter med en IUD, øker imidlertid risikoen for ektopisk graviditet.Visse p-piller med lavere progestogendoser kan også forårsake unormale sammentrekninger i egglederne, noe som kan føre til ektopisk graviditet. Svikt i nødprevensjon med høyt østrogeninnhold for å forhindre graviditet øker på samme måte risikoen for graviditet i egglederne.