Kõhuvälise raseduse täpsed põhjused on endiselt ebaselged, kuigi peamine tegur on tõenäoliselt munajuhade anomaaliad.
Patsientidel, kellel on krooniline salpingiit, apenditsiit, vaagna tuberkuloos, peritoniit või endometrioos, võivad tekkida munajuhade adhesioonid, kitsenemised või osalised ummistused, mis suurendavad kõhuvälise raseduse riski.Lisaks võivad alaarenenud munajuhad takistada viljastatud munaraku normaalset liikumist. Ka kaasasündinud anomaaliad, nagu munajuhade divertikulaadid või lisafimbriad, võivad kaasa aidata emakavälise raseduse tekkele.
Kui munajuhade ebanormaalsused ei ole põhjuseks, võib emakaväline rasedus olla tingitud viljastatud munaraku rändamisest. Pärast viljastumist ühes munajuhas võib viljastatud munarakk liikuda emakaõõnest vastaspoole munajuhasse, seal implanteeruda või rännata kõhuõõnes. Pikem ränne võimaldab areneval embrüol kasvada, mis võib viia munajuharaseduseni. Teine kaasaaitav tegur on rasestumisvastaste vahendite ebaõnnestumine.
Paljud naised kasutavad praegu rasestumisvastase vahendina emakasiseseid vahendeid (IUD), mida tavaliselt nimetatakse „IUD paigaldamiseks”. Kui IUD-ga rasestumisvastane vahend ebaõnnestub, suureneb emakavälise raseduse risk.Teatavad madalama progesteroonidoosiga rasestumisvastased pillid võivad samuti põhjustada ebanormaalset munajuhade kokkutõmbumist, mis viib emakavälise raseduseni. Kõrge östrogeenitasemega erakorralise rasestumisvastase vahendi ebaõnnestumine raseduse vältimisel suurendab samuti munajuhade raseduse riski.