Las causas exactas del embarazo ectópico siguen sin estar claras, aunque es probable que el principal factor contribuyente sean las anomalías en las trompas de Falopio.
Las pacientes con antecedentes de salpingitis crónica, apendicitis, tuberculosis pélvica, peritonitis o endometriosis pueden desarrollar adherencias, estrechamiento u obstrucciones parciales en las trompas, lo que aumenta el riesgo de embarazo ectópico.Además, las trompas de Falopio poco desarrolladas pueden impedir el avance normal del óvulo fecundado. Las anomalías congénitas, como los divertículos tubáricos o las fimbrias accesorias, también pueden contribuir al embarazo ectópico.
Cuando las anomalías tubáricas no son la causa, el embarazo ectópico puede deberse a un óvulo fecundado errante. Tras la fecundación en una trompa de Falopio, el óvulo fecundado puede atravesar la cavidad uterina hasta la trompa opuesta, implantarse allí o vagar por la cavidad abdominal. La migración prolongada permite que el óvulo fecundado crezca, lo que puede dar lugar a un embarazo tubárico. El fallo de los anticonceptivos es otro factor que contribuye a ello.
Muchas mujeres utilizan ahora dispositivos intrauterinos (DIU) como método anticonceptivo, lo que se conoce comúnmente como «colocación de un DIU». Sin embargo, si falla la anticoncepción con un DIU, aumenta el riesgo de embarazo ectópico.Ciertas píldoras anticonceptivas con dosis más bajas de progestágeno también pueden causar contracciones tubáricas anormales, lo que conduce a un embarazo ectópico. Las mujeres que conciben después de un fallo anticonceptivo con anticonceptivos de emergencia que contienen altos niveles de estrógeno también se enfrentan a un mayor riesgo de embarazo tubárico.