Die genauen Ursachen einer Eileiterschwangerschaft sind nach wie vor unklar, obwohl der Hauptfaktor wahrscheinlich Anomalien der Eileiter sind.
Patientinnen mit einer Vorgeschichte von chronischer Salpingitis, Blinddarmentzündung, Becken-Tuberkulose, Peritonitis oder Endometriose können Eileiterverwachsungen, Verengungen oder teilweise Blockaden entwickeln, wodurch das Risiko einer Eileiterschwangerschaft steigt.Darüber hinaus können unterentwickelte Eileiter den normalen Transport der befruchteten Eizelle behindern. Angeborene Anomalien wie Eileiterdivertikel oder akzessorische Fimbrien können ebenfalls zu einer Eileiterschwangerschaft beitragen.
Wenn keine Eileiteranomalien vorliegen, kann eine Eileiterschwangerschaft durch eine wandernde befruchtete Eizelle verursacht werden. Nach der Befruchtung in einem Eileiter kann die befruchtete Eizelle die Gebärmutterhöhle durchqueren, sich im gegenüberliegenden Eileiter einnisten oder innerhalb der Bauchhöhle wandern. Eine längere Wanderung ermöglicht es dem sich entwickelnden Embryo, zu wachsen, was möglicherweise zu einer Eileiterschwangerschaft führt. Ein weiterer Faktor ist das Versagen von Verhütungsmitteln.
Viele Frauen verwenden heute Intrauterinpessare (IUP) zur Empfängnisverhütung, was gemeinhin als „IUP einsetzen lassen” bezeichnet wird. Wenn jedoch die Empfängnisverhütung mit einem IUP versagt, steigt das Risiko einer Eileiterschwangerschaft.Bestimmte Antibabypillen mit niedrigeren Gestagendosen können ebenfalls abnormale Kontraktionen der Eileiter verursachen, was zu einer Eileiterschwangerschaft führen kann. Frauen, die nach einem Versagen der Verhütung mit einer Notfallverhütung mit hohem Östrogengehalt schwanger werden, haben ebenfalls ein erhöhtes Risiko für eine Eileiterschwangerschaft.