茜草根具藥用價值，性寒味微苦帶酸，能涼血止血、活血化瘀。炒製後可治療吐血、鼻血、血便、月經過多、血尿等症狀；生用則可治療經期不順伴隨腹痛、瘀傷腫痛等問題。其療效顯著的方劑如下：
瘀傷：茜草根120克、紅花20克、川芎30克、白酒1000毫升。將藥材浸泡於白酒中七日，每日兩次，每次服用30毫升。
慢性腹瀉：茜草、山藥適量炒至焦黑，保留藥性後研粉，加少許黑糖。每日三次，每次九克於飯前服用。每週為一個療程。
月經提前・量多・深紅色：茜草十五克、荊芥炭九克、牡丹皮十克、烏賊骨九克。煎服，自月經前一週開始服用，每日一劑，連續服用五至七日。
痔瘡腫痛：茜草30克、大黃10克、虎杖15克、地榆15克。煎服，每日一劑，連續服用七日。
蕁麻疹：茜草根20克、地膚子・蛇床子各10克。煎煮後以黃酒送服，每日一劑。
慢性支氣管炎：茜草20克、浙貝母10克、杏仁10克、麻黃5克、石膏30克、甘草10克。水煎，每日一劑。
過敏性紫斑病：茜草根30克、生地黃15克、元參12克、牡丹皮10克、防風10克、白芍10克、黃芩10克、甘草6克。水煎，每日一劑。
口腔潰瘍：茜草20g、黃連5g。水煎。每日一劑，連續服用14日。
外傷出血：茜草根・三七適量研粉，患部外用。每日一次。