小児急性腸炎は2歳未満の乳幼児に多い疾患で、主な症状は下痢であり、不適切な食事や腸管内・腸管外の感染によって引き起こされる。腸管内感染では病原性大腸菌腸炎が最も多い。人工栄養児は母乳育児児より発症率が高く、その原因は動物乳の汚染リスクに加え、母乳に含まれるビフィズス菌増殖促進性ムコ多糖類にも関係している。ビフィズス菌は大腸菌の増殖を抑制する。
腸管感染症は、細菌性赤痢、コレラ、鼠傷寒などのほか、その他の細菌性、ウイルス性、寄生虫性、真菌性および原因不明の感染性下痢もすべて腸炎と呼ぶことができる。
2歳未満の乳幼児が秋冬に流行性下痢を発症し、卵白様または白色の水様便で膿血便を伴わない場合、ロタウイルス腸炎の可能性が高い。夏季に発生する場合は大腸菌による可能性が高い。便に粘液・膿血が混じる場合は細菌性赤痢、カンピロバクター・ジェジュニまたはサルモネラ・チフスによる腸炎を考慮すべきである。
軽症下痢の場合、消化しにくい食物や高脂肪食を控え、一時的に米湯・豆乳・ヨーグルト・脱脂乳を摂取する。母乳育児の場合は授乳時間を短縮する。重症下痢の小児は速やかに病院へ搬送する。自宅で治療する軽症下痢には経口補水液を投与し、1袋を500mlの水で溶かし少量ずつ複数回に分けて飲ませる。軽度脱水時は体重1kgあたり1日50ml、中等度脱水時は同80～100mlとする。嘔吐・下痢が改善してから3～4日後に徐々に通常食へ移行する。
小児の腸炎では、条件が許せば便検査や培養検査を行い確定診断することが望ましい。大腸菌性腸炎の場合、ポリミキシンBを体重1kgあたり5～10万単位を1日3～4回に分けて投与するか、カナマイシンを体重1kgあたり50mgを1日3～4回に分けて経口投与する。治療期間は7日を超えないようにし、腸内細菌叢の乱れを防ぐ。
カンピロバクター腸炎にはエリスロマイシンを体重1kgあたり30～50mg/日、3～4回に分けて経口投与する。
真菌性腸炎にはクロトリマゾールを体重1kgあたり20～60mg/日、3回に分けて経口投与する。
ウイルス性腸炎は抗生物質が効果を示さない場合、漢方製剤「卓丹止泻灵」が有効。1～3歳は1回5mlを1日3回、3～7歳は1回10mlを1日3回が推奨。