尿路結石の主な症状は排尿困難、排尿時の力み、滴下状の排尿、尿流中断や尿閉の発生である。排尿時に明らかな疼痛が生じ、陰茎頭部へ放散することがある。後尿道結石では会陰部や陰嚢部に痛みが生じる。陰茎部結石では疼痛部位に触知可能な腫瘤があり、強く排尿することで結石が排出されることがある。完全閉塞では急性尿閉を起こす。感染を合併すると尿道から膿性分泌物が出る。女性尿道憩室結石は主に下部尿路感染症症状を示し、頻尿、排尿痛、夜間頻尿、膿尿、血尿があり、性交痛が顕著な症状で、時に尿道からの排膿を伴う。男性尿道憩室結石では、尿道分泌物や排尿痛に加え、陰茎下部に次第に増大する硬い腫瘤が出現し、明らかな圧痛を伴うが排尿障害症状はない。
全ての尿路結石症患者が体外衝撃波砕石術（ESWL）に適応するわけではない。体外衝撃波砕石術（ESWL）には一定の適応症と禁忌症がある。一般的に以下の状況では砕石機による排石が可能：
ESWLは直径≤2cmまたは表面積≤300mm²の腎結石治療の標準的手法である。直径≥2cmの腎結石および鹿角状結石には経皮的腎結石摘出術（PNL）またはESWLとの併用が推奨される。
直径≤1cmの上部尿管結石にはESWLが第一選択
1-1.5cmの上部尿管結石にはESWL、尿管鏡（URS）、PNLが選択可能。≥1.5cmの上部尿管結石にはPNL結石摘出術（L4レベル以上）、腹腔鏡下結石摘出術、開腹結石摘出術が適応。直径≤1.5cmの尿管中下部結石にはESWLとURSを選択可能、≥1.5cmの場合は腹腔鏡下結石摘出術と開放手術による結石摘出を選択可能。
膀胱結石も体外衝撃波砕石術が可能だが、方法は異なり、一般に経尿道的腔内砕石術が主に用いられる。
尿道結石は一般的にESWLに適さず、治療には膀胱結石と同様の内視鏡的処置法が採用される。
以下の状況では砕石機を使用できない：⒈結石下流の尿路閉塞因子が解除されていない場合；⒉出血性疾患患者；⒊結石部位の感染が効果的に制御されていない場合；⒋心・肝・腎機能不良者；⒌妊婦；⒍過度の肥満により焦点定位が困難な者；⒎猫背の者；⒏腎動脈硬化症の者など。
砕石治療後、尿路結石は直ちに排出されるわけではない。砕石装置は「排石装置」ではなく、結石を排出する機能を持たず、尿路を通過可能な微小破片に砕くのみである。砕石の排出可否は、腎臓の尿生成量、尿管の通過性とその砕石推進力、砕石の大きさなど多くの要因に左右される。そのため砕石治療後、医師はしばしば利尿剤、尿管拡張薬、尿管運動促進薬を投与し、砕石排出を助けて排石時間を短縮する。