泌尿系統感染泛指尿道與膀胱的感染。尿道是從膀胱將尿液排出體外的通道，因尿道與膀胱緊密相連，尿道感染常會向上蔓延引發膀胱炎。此類感染多由大腸桿菌引起，這些細菌潛伏於陰道內並侵入尿道。此類細菌普遍存在於所有女性體內。男性雖亦可能罹患，但相對罕見，男性泌尿系統感染通常由性傳播疾病引起。非特異性尿道炎與淋病這兩種性傳播疾病，最常引發尿道及膀胱發炎。
藥物治療
以下為泌尿系統感染治療主要用藥。雖可於藥局購得，但專家建議若出現不適症狀，務必至醫療機構接受專業檢查，避免自行用藥。錯誤用藥恐導致嚴重後果。1 阿莫西林：屬廣譜抗生素，對多種陽性菌有效，適用於皮膚黏膜、軟組織及泌尿系統感染等。
2 諾氟沙星與左氧氟沙星：主要用於中呼吸道、腸胃道感染等，對泌尿系統感染亦具顯著療效。
3 頭孢曲松鈉：適用於腸桿菌科等敏感菌引起之下呼吸道感染、皮膚軟組織與骨感染、尿路感染、肝膽道感染、腹腔內感染、淋病、菌血症、腦膜炎等。靜脈注射。
4 頭孢拉定：別名頭孢他啶。適用於支氣管炎、肺炎、腎盂腎炎、膀胱炎、耳鼻喉感染症、腸炎、痢疾等呼吸系統、泌尿系統及皮膚軟組織感染。
5 諾氟沙星：用於衣原體、支原體引起的尿道炎、子宮頸管炎等。
6 磺胺類藥物：對多數大腸桿菌具強效抗菌作用，尿液溶解度高、耐藥性發生率低且價格低廉，故常作為初次感染時的首選藥物。常用製劑為磺胺甲噁唑（SMZ），多與增效劑甲氧苄啶（TMP）併用（即複方製劑磺胺甲噁唑SMZco）。劑量為50mg/kg/日，每日分兩次服用。通常療程為1至2週。為防止尿液結晶形成，需大量飲水。腎功能障礙時應謹慎使用。
7 哌嗪酸（pipemidic acid, PPA）：對大腸桿菌引起的尿路感染具高尿液排泄率與顯著療效。適用於各類尿路感染。劑量為30-50mg/（kg・日），分3-4次口服。副作用較少，偶見輕微胃部不適。幼兒使用時需謹慎。
8 氟坦嗪：抗菌譜廣，對大腸桿菌具顯著效果且不易產生抗藥性。劑量為8-10mg/kg·日，分三次口服。易引發胃腸反應，應於餐後服用。可與雙氧苄胺（TMP）併用。對於需持續治療3-4個月之難治性感染，尤適宜使用氟坦嗪。
9 氟羅沙星：喹諾酮類全合成廣譜抗菌劑。對革蘭氏陰性菌與陽性菌具強效抗菌作用。劑量5-10mg/kg/日，每日口服3-4次。因抗菌作用強勁，長期使用恐導致腸道菌叢失衡需謹慎。通常不適用於幼兒。
10 氨基苯甲酰青黴素、頭孢唑林：皆屬廣譜抗生素，具良好抑菌作用，常用於尿路感染治療。卡那黴素、慶大黴素雖具優異抑菌效果，然腎毒性強且易影響聽覺，使用時須謹慎評估。
治療期間考量：急性感染期若選用之抗生素對病原菌具敏感性，多數患者經10日療程即可控制感染，若無發熱症狀者5日療程亦可能足夠。痊癒後應定期追蹤觀察逾一年。因復發多屬再感染所致，故不建議所有患者皆施行長期療法。
具體建議如下：①復發頻率低之患者，於復發時實施急性期治療。②反覆復發患者，待急性症狀控制後，每晚睡前服用低劑量（治療劑量之1/3～1/4）之磺胺甲噁唑（SMZco）、氟替卡松、哌嗪酸或氟哌嗪嗪其中一種藥物。治療期可持續3～6個月。若患者反覆感染頻發或腎實質已存在其他損傷，治療期可延長至1～2年。為預防耐藥菌株產生，應採用聯合療法或輪替療法（每種藥物使用2～3週後更換其他藥物），以提升治療效果。