Ženy, ktoré plánujú tehotenstvo a nepoužívajú antikoncepciu, by sa mali vyhýbať liekom, pokiaľ to nie je nevyhnutné. Ak je liečba potrebná, mali by sa použiť antikoncepčné opatrenia, najmä v druhej polovici menštruačného cyklu, kedy by sa lieky mali vyhnúť, ak je to možné. Ak je liečba nevyhnutná, je dôležité proaktívne informovať lekára o zámere otehotnieť bez antikoncepcie.
Aby sa predišlo neplánovanému tehotenstvu počas užívania liekov, tehotným ženám sa odporúča sledovať svoju bazálnu telesnú teplotu. Ak antikoncepcia zlyhá, lekári môžu poskytnúť poradenstvo na základe vzťahu medzi načasovaním liečby a počatím. Otázka, či liečba vyžaduje prerušenie tehotenstva, zostáva predmetom diskusie. Vo všeobecnosti by sa rozhodnutie o pokračovaní alebo prerušení tehotenstva malo zvážiť na základe rizík a prínosov, pričom by sa mali zohľadniť faktory ako vek páru, história plodnosti a ich túžba po dieťati.
Treba poznamenať, že aj tehotné ženy, ktoré neužívajú lieky, môžu porodiť deti s abnormalitami, zatiaľ čo liečba nemusí nevyhnutne zaručiť zdravý výsledok. V súčasnosti však neexistuje definitívna metóda na potvrdenie vplyvu liekov na ľudské embryá, pričom všetky dôkazy pochádzajú zo štúdií na zvieratách. Všeobecným princípom je, že liečba počas tehotenstva by sa mala v prípade možnosti vyhnúť, najmä v raných štádiách. Najdôležitejším princípom by mala byť ochrana zdravia matky.