Kobiety planujące ciążę, które nie stosują antykoncepcji, powinny unikać przyjmowania leków, chyba że jest to konieczne. Jeśli choroba wymaga leczenia, należy stosować środki antykoncepcyjne, szczególnie w drugiej połowie cyklu miesiączkowego, kiedy to w miarę możliwości należy unikać przyjmowania leków. Jeśli konieczne jest przyjmowanie leków, należy poinformować lekarza o zamiarze poczęcia dziecka bez stosowania antykoncepcji.
Aby zapobiec nieplanowanej ciąży podczas przyjmowania leków, przyszłym matkom zaleca się monitorowanie podstawowej temperatury ciała. W przypadku niepowodzenia antykoncepcji lekarze mogą udzielić wskazówek w oparciu o związek między czasem przyjmowania leków a poczęciem. Kwestia, czy przyjmowanie leków wymaga przerwania ciąży, pozostaje przedmiotem dyskusji. Ogólnie rzecz biorąc, decyzja o kontynuowaniu lub przerwaniu ciąży powinna być rozważona pod kątem ryzyka i korzyści, biorąc pod uwagę takie czynniki, jak wiek pary, historia płodności i pragnienie posiadania dziecka.
Należy zauważyć, że kobiety w ciąży, które nie przyjmują leków, mogą nadal rodzić dzieci z nieprawidłowościami, podczas gdy leki niekoniecznie gwarantują zdrowy wynik. Obecnie nie ma jednak ostatecznej metody potwierdzającej wpływ leków na embriony ludzkie, a wszystkie dowody pochodzą z badań na zwierzętach. Ogólną zasadą jest unikanie stosowania leków w czasie ciąży, w szczególności we wczesnym stadium. Nadrzędną zasadą powinno być zapewnienie zdrowia matki.