Prinsip pengobatan untuk sekresi kuning, berdarah, serosa, atau kental akibat infeksi amoeba: prioritaskan terapi sistemik dikombinasikan dengan pengelolaan lokal. Obat-obatan umum meliputi:
1. Carbarsene: 0,25 g dua kali sehari selama 10 hari per kursus;
2. Metronidazole: 200–400 mg tiga kali sehari selama 10–14 hari per kursus;
3. Biji rhubarb efektif untuk amoebiasis akut dan juga dapat digunakan untuk pasien kronis dan pembawa. Konsumsi 10–15 biji secara oral tiga kali sehari selama 7 hari.
Pengobatan lokal: Siapkan larutan obat-obatan di atas untuk irigasi vagina, atau formulakan menjadi bubuk atau supositoria untuk pemasangan vagina sekali sehari selama 7–10 hari.