藿香正氣水由藿香、厚朴、法夏、紫蘇等成分構成，具芳香化濕、解暑發表之效，適用於盛夏時節因外感風寒或內傷生冷所致之惡寒發熱、頭痛、脘部鬱滯、嘔吐腹瀉等症狀，主要內服使用。臨床觀察發現其外用治療亦具諸多新功效，茲列舉如下：
1．取吳茱萸粉末10克溶於藿香正氣水，塗抹於肚臍後以傷濕止痛膏固定。每日更換一次，連續使用三日。具芳香化濕、理氣止痛之效，適用於暑濕或寒濕所致腹瀉。
2．取等量丁香與黑胡椒研磨成細粉儲於瓶中。使用時取適量粉末以藿香正氣水調和，外敷於臍孔處。以繃帶固定並貼敷創可貼，每日更換一次，連續使用三日。或取車前子、丁香、肉桂、枯礬等量研細粉，以藿香正氣水調成糊狀外敷臍穴。以傷濕止痛膏固定，每日更換一次，連續使用3～5日。具溫中固下、芳香化濕、理氣止痛之效，適用於慢性大腸炎。
3．取等量丁香、肉桂研細粉，裝瓶保存。使用時取適量粉末，以藿香正氣水均勻調和，敷於臍穴並以傷濕止痛膏固定。每日更換一次，連續使用三日。具芳香化濕、理氣止痛之效，適用於小兒秋季腹瀉。
4．取適量本品浸潤消毒棉棒塗抹患處，每日3～5次，連續使用3～5日。具祛濕止癢功效，適用於小兒瘙癢性皮膚病。
5．黃耆10克、蒼朮6克、丁香4克、冰片1克共同研細粉末，裝瓶備用。使用時取適量藥粉，以藿香正氣水調成糊狀，塗抹於肚臍穴外用。以繃帶固定並貼敷創可貼。每日更換一次，持續使用7～10日。具有補氣健脾功效，適用於兒童反覆性呼吸道感染。
6．取適量本品浸潤消毒棉棒塗抹患處，每日3～5次，連續使用3～5日。具祛濕止癢功效，適用於陰囊濕疹。
7．將藿香正氣水以等量冷水稀釋均勻混合。使用前清洗患處並以生理食鹽水消毒，再塗抹本劑。每日3～4次，連續使用3～5日。具清熱除濕功效，適用於兒童癤腫（癤）。
8．患部清潔後取少量本品塗抹患處，以手輕揉至局部發熱。每日3次，連續使用1週。透過促進血液循環與疏通經絡作用緩解腫痛，適用於凍瘡初期。惟患處伴隨紅腫硬結或已潰瘍化之凍瘡禁用。冬季每日於患處塗抹少量，亦具凍瘡預防功效。
9．先以溫水或淡鹽水沖洗患處並擦乾。取適量藥液浸潤棉棒塗抹患處，至少維持2小時。每日進行1～2次。若出現水皰並滲出黃色液體，塗抹後4～8小時水皰將逐漸消退，12小時後乾燥皮屑會自然脫落。其芳香作用可化濕除濕，適用於足癬。
10．每日於腋窩塗抹適量藿香正氣水，或將本品適量灑於內衣，可有效阻隔異味，預防腋臭。
11．取凌霄花100克加水1500毫升，煎煮30分鐘後濾除渣滓，取汁液加入藿香正氣水2瓶均勻混合。用於坐浴清洗患處。每日兩次，連續使用3～5日。具祛風除濕、緩解搔癢疼痛之效，適用於陰部搔癢。