Nesprávna aplikácia môže spôsobiť popáleniny kože, začervenanie, opuchy alebo pľuzgiere. Hoci ide o profesionálnu metódu odstraňovania škvŕn a akné, nesprávne postupy môžu poškodiť sietnicu oka, čo môže viesť k závažným komplikáciám, ako je strata zraku.
Odstránenie škvŕn laserom je všeobecne vhodné pre osoby bez citlivosti na svetlo, cukrovky, hypertenzie, duševných porúch, tehotenstva, nedávneho spálenia slnkom v priebehu dvoch týždňov alebo zápalových ochorení tváre, ako je melasma spôsobená gynekologickými problémami.
Laserové odstraňovanie škvŕn nemá spravidla žiadne vedľajšie účinky a nespôsobuje žiadne nežiaduce reakcie organizmu. Výsledky však závisia od kvality zákroku a dôkladnosti pooperačnej starostlivosti. Medzi stravovacie opatrenia po zákroku patrí vyhýbanie sa vysoko pigmentovaným a pikantným jedlám, aby sa predišlo lokálnej pigmentácii. Je veľmi dôležité, aby bola ošetrená oblasť pokožky udržiavaná v čistote, aby sa predišlo bakteriálnej infekcii.