Feil bruk kan forårsake brannskader, rødhet, hevelse eller blemmer på huden. Selv om dette er en profesjonell metode for fjerning av flekker og kviser, kan feil prosedyrer skade netthinnen i øyet, noe som i alvorlige tilfeller kan føre til søvnløshet.
Laserfjerning av pigmentering er generelt egnet for personer uten lysfølsomhet, diabetes, hypertensjon, psykiske lidelser, graviditet, nylig solbrenthet innen to uker eller inflammatoriske ansiktslidelser som melasma forårsaket av gynekologiske problemer.
Laserfjerning av flekker har generelt ingen bivirkninger og gir ingen uønskede kroppslige reaksjoner. Resultatene avhenger imidlertid av kvaliteten på prosedyren og grundigheten av etterbehandlingen. Etter behandlingen må man unngå matvarer med høyt innhold av pigmenter eller krydder for å forhindre lokal pigmentering. Det er svært viktig at det behandlede hudområdet holdes rent for å forhindre bakteriell infeksjon.