疫学調査の結果によると、肥満女性は子宮内膜癌や閉経後乳癌にかかりやすく、肥満男性は前立腺癌にかかりやすい。また、男女を問わず肥満者は大腸癌や直腸癌にもかかりやすい。肥満が深刻であればあるほど、これらのがんの発症率は高くなる。
2、様々な血管疾患を引き起こす
肥満は様々な血管疾患を引き起こしやすい。肥満者は皮下脂肪が過剰に蓄積するだけでなく、内臓や全身の血管内にも脂肪が堆積するため、特に健康や生命に深刻な脅威となる心脳血管疾患をはじめとする多様な血管疾患を引き起こしやすい。関連研究データによると、肥満者の高血圧発症率は正常体重者の1.5～3倍である。さらに肥満度が高いほど高血圧発症率も上昇し、血圧上昇も顕著になる。重度の肥満者の高血圧発症率は50％以上に達する。逆に、様々な減量措置を講じて体重を減らすと、血圧もそれに応じて低下する。
3、糖尿病を誘発しやすい
肥満が糖尿病の直接的な原因とは言えないものの、その誘発作用は無視できない。多くの資料が、肥満度が高いほど糖尿病発症率も高くなることを裏付けている。現在、一部の経済先進国では、肥満が引き起こす疾患の中で最も多いのが糖尿病である。成人型糖尿病患者の約3分の1が肥満体型に属する。ほぼ全ての肥満者は、空腹時血糖値が何らかの程度で上昇している。
4、運動器疾患を引き起こしやすい
肥満者の過剰な体重増加は、骨や関節などの運動器系、特に脊椎と下肢に余分な負担をかける。骨や関節などの組織が長期にわたり過剰な体重を支えることは、毎日余計な荷物を背負い続けるようなもので、やがて疲労が蓄積して関節炎、筋肉疲労、脊髄神経根圧迫を引き起こし、腰・脚・肩・背中の痛みを生じさせ、さらには関節変形を招き、身体活動に深刻な影響を及ぼす。
5、脂質異常症を引き起こす
肥満者、特に腹部肥満者は、一般人に比べて高コレステロール血症、高トリグリセリド血症、LDLコレステロールとVLDLコレステロールの異常上昇を示しやすく、逆にHDLコレステロールは低下する傾向がある。肥満者が高脂血症になりやすい原因は現時点では完全には解明されていませんが、以下の点が考えられます：第一に脂肪摂取量の多さ、第二に体内の脂肪蓄積量が多いこと、第三に高インスリン血症が血中脂質を上昇させること、第四に血中脂質の除去機能に問題があること。
6、高血圧発症リスクの増加
肥満と高血圧は密接に関連している。40～50歳の肥満者における高血圧発症率は非肥満者より50%高い。中度肥満者の高血圧発症リスクは標準体重者の5倍以上、軽度肥満者の2倍以上である。
7、心臓への負担増大
肥満者の狭心症や突然死の発生率が4倍に上昇することが確認されている。これは肥満が確実に心臓への負担を増大させ、心臓障害を引き起こすことを示している。正常な心臓はポンプのように収縮と拡張を繰り返し、血液循環を維持している。肥満者は血液中に過剰な脂肪が蓄積するため、血液量も相応に増加し、心臓は収縮力を強めざるを得ない。心臓が負荷に耐えられなくなると、効果的な血液ポンプ機能が失われ、心血管系に血液が滞留する状態が生じる。重症例では明らかな心不全を引き起こすこともある。
8、脂肪肝を引き起こす
肥満者の約半数が脂肪肝を患っている。肝臓はトリグリセリド（中性脂肪）を合成する場所であるが、肝内にはそれを貯蔵する余剰スペースがほとんどない。肥満者の体内ではトリグリセリドの合成と輸送のバランスが崩れ、脂肪酸の摂取量が多いため、肝臓で合成されるトリグリセリドも増加する。大量のトリグリセリドが肝臓内に蓄積し、結果として脂肪肝を形成する。
9、骨関節疾患を引き起こす
肥満が引き起こす可能性のある骨関節疾患は主に三種類：変形性関節症、糖尿病性骨関節症、痛風性骨関節症。このうち最も発生頻度が高く、危害が大きいのは変形性関節症である。肥満による変形性関節症は主に膝関節に影響し、次いで股関節や手指関節などに影響を及ぼす。
10、栄養吸収の阻害
肥満は一種の栄養障害である。長年、体格ががっしりしていることが栄養状態の良さを意味すると誤解する人々がいる。しかし実際には、肥満は栄養状態の良さを意味せず、痩せすぎと同様に栄養障害によるものであり、両者の違いは体内に蓄積された脂肪の量だけである。肥満は体内の脂肪過剰であるだけでなく、特定の栄養素の欠乏も同時に存在する。例えば多くの肥満児は、鉄分やカルシウムなどの微量元素が不足しており、鉄欠乏性貧血やくる病など様々な栄養欠乏性疾患を引き起こす。