隨著肉毒桿菌在除皺、小臉塑形、小腿瘦身、齦笑症治療、腋臭治療等臨床應用範圍擴大，受益人群持續增加。然而安全疑慮亦隨之浮現。門診常見提問包括：「懷孕期間可施打肉毒桿菌嗎？哺乳期能接受注射嗎？術後延遲懷孕是否安全？」若注射後不久意外懷孕，生產此胎是否安全？是否可能導致胎兒畸形？本文將針對上述疑慮進行說明：
中國境內經國家藥品監督管理局核准臨床使用的肉毒桿菌製劑僅有「衡力（亨利）」與「保妥適（Botox）」。以下引用兩款藥劑針對孕婦及哺乳婦女的使用說明：
妊娠
目前尚無足夠數據支持非孕婦使用本品。動物實驗雖確認其具生殖毒性，但此風險對人體的影響尚不明確。除非確信使用效益高於潛在風險，否則孕婦通常不應使用本品。
哺乳
目前無數據顯示本品會分泌至乳汁中，故不建議哺乳期婦女使用。
懷孕期間可施打肉毒桿菌素嗎？
並非絕對禁止，但僅限於治療效益高於潛在風險之情況。若純粹為美容目的，相較於胎兒安全，其效益較小，應避免施打肉毒桿菌素。
但若因強直性頸部痙攣等疾病嚴重影響孕婦健康甚至危及生命時，應以治療為目的施打肉毒桿菌素（相關臨床文獻可資佐證）。
哺乳期間可施打肉毒桿菌素嗎？
不可。請絕對避免。
目前尚無研究文獻探討肉毒桿菌是否會移行至母乳，亦無證據顯示其可能對嬰兒造成不良影響，故缺乏判斷依據。
若注射肉毒桿菌後不久發現意外懷孕該如何處理？
應優先保護胎兒，同時實施嚴格產檢，一旦發現異常應立即採取處置措施。
理論上，肉毒桿菌導致胎兒發育異常需反覆高劑量使用才會發生，一般治療（例如為小臉目的施打100單位）對人體的影響極微，可視為可忽略程度。
然而考量現代生活環境（水源、食品、空氣、居住環境的嚴重污染風險）可能引發胎兒發育異常，問題便趨於複雜。無論製藥公司或主治醫師，皆無法承擔風險斷言「本品對孕婦安全」。因此建議肉毒桿菌注射後至少三個月內避免懷孕。