Medzi hlavné faktory prispievajúce k rozštepu pery patria:
1. Vírusové infekcie:
Napríklad infekcie horných dýchacích ciest alebo ružienka u tehotných žien.
2. Účinky liekov:
Napríklad antiepileptiká, lieky na zníženie cholesterolu, lieky proti alergii alebo lieky proti rakovine.
4. Výživové faktory:
Nedostatok vitamínu D, kyseliny listovej, železa, vápnika atď. spôsobený vracaním, anorexiou alebo selektívnym stravovaním v ranom štádiu tehotenstva.
5. Vonkajšie faktory:
Napríklad vystavenie röntgenovému žiareniu, fajčenie (aktívne alebo pasívne), alkohol (nadmerná konzumácia) alebo hypoxia (anestézia alebo výšková choroba).
Vhodné doplnky kyseliny listovej počas tehotenstva môžu pomôcť predchádzať vrodenej rozštepenej pere a podnebiu. Nedostatočný príjem kyseliny listovej počas tehotenstva zvyšuje riziko narodenia dieťaťa s rozštepenou perou až šesťnásobne. Ženám v reprodukčnom veku sa odporúča užívať doplnky kyseliny listovej pod lekárskym dohľadom.