豆乳並非適合所有人飲用。由於豆乳性質屬寒涼，消化不良、易打嗝或腎功能低下者應避免攝取。此外，豆乳在酵素作用下會產生氣體，腹脹或腹瀉者亦宜避免飲用。大豆富含嘌呤且具寒性，故痛風症狀、倦怠感、體力衰退、精神疲勞等虛寒體質者不宜飲用豆漿。
切勿在豆漿中添加黑糖。因黑糖所含多種有機酸會與豆漿中的蛋白質分解酵素結合，導致蛋白質變性沉澱，阻礙人體吸收。白糖則不會產生此現象。
雖有以保溫瓶保存豆乳的習慣，但此舉並不推薦。保溫瓶的溫濕環境極易滋生細菌。此外，豆乳所含皂苷會溶解保溫瓶水垢，攝入後恐危害健康。
豆乳務必煮沸，且煮沸過程中必須保持開蓋狀態。開蓋可使豆乳中的有害物質隨水蒸氣揮發。
需特別注意的是，豆漿不可與紅黴素等抗生素同時攝取。兩者會產生拮抗化學反應，建議飲用豆漿後至少間隔一小時再服用抗生素。