A szójatej fogyasztása nem általánosan ajánlott, mivel hűsítő hatása van. Azok, akiknek gyenge az emésztésük, puffadásuk van vagy vesefunkciójuk károsodott, minimálisra kell csökkenteniük a fogyasztását. Ezenkívül a szójatej enzimhatás alatt gázt termel, ezért nem alkalmas azok számára, akik puffadással vagy hasmenéssel küzdenek.A szójabab magas purintartalommal rendelkezik, és hideg természetű élelmiszernek minősül. Ezért a hideghiányos alkatú, köszvény, fáradtság, fizikai gyengeség vagy mentális kimerültség tüneteit mutató személyeknek kerülniük kell a szójatejet.
A szójatejhez nem szabad barna cukrot adni, mert annak szerves savai reakcióba lépnek a tejben található proteázokkal, ami a fehérjék denaturálódását és kicsapódását okozza, ami rontja a felszívódást. A fehér cukor nem mutat ilyen hatást.Ráadásul a szójatejben található szaponinok feloldhatják a termoszkban lerakódott vízkövet, amelynek fogyasztása káros lehet az egészségre.
A szójatejet nem csak teljesen fel kell forralni, hanem fedő nélkül is főzni kell. Ennek oka, hogy csak fedő nélkül tudnak a szójatejben található káros anyagok a gőzzel együtt elpárologni.
Fontos megjegyezni, hogy a szójatejet soha nem szabad antibiotikumokkal, például eritromicinnel együtt fogyasztani, mivel azok antagonista kémiai reakciókat válthatnak ki. A szójatej fogyasztása és az antibiotikumok szedése között legalább egy óra szünetet kell tartani.