部分成年人習慣於早晨飲用牛奶，但此方法缺乏科學依據。原因在於經過一夜睡眠後，胃部已處於空虛狀態並準備消化食物，此時胃部排空速度較快；而牛奶作為液態乳汁，更會加速胃部排空。若在空腹時飲用牛奶，其營養成分尚未經胃部充分消化吸收便會被排出腸道，導致營養流失。牛奶富含優質蛋白質，其主要功能在於構成人體新組織並修復既有組織。空腹飲用牛奶不僅加速排出，更會使珍貴蛋白質被人體分解轉化為熱量消耗，導致蛋白質無法發揮應有功效，實屬可惜。
牛奶中的蛋白質需經胃部胃蛋白酶分解，再於小腸轉化為各類胺基酸，方能被小腸吸收利用。空腹飲用牛奶會加速胃部排空，導致部分蛋白質未能分解為胺基酸，而部分胺基酸則在未被小腸吸收前便被排出至大腸。這些蛋白質與胺基酸在大腸內會發生分解腐敗，轉化為對人體有害的物質。此現象不僅使珍貴蛋白質無法充分發揮應有功效，更將加重人體負擔。
飲用時機亦會影響體內消化吸收效率。兒童飲用牛奶應依年齡調整每日飲用次數、時間與份量；成人則需特別留意飲用時機。
改善此狀況的關鍵在於：首先避免於早餐前空腹飲用牛奶，改於早餐後1至2小時飲用。胃中存有食物可避免空腹飲用的缺點。其次，飲用牛奶前應攝取饅頭等澱粉質豐富的食物。第三，晨間飲用牛奶時應同時搭配麵包、米飯、餅乾、點心等澱粉類食品。如此可延長牛奶滯留胃中的時間，充分發揮胃液與酵素的分解作用，促進蛋白質消化吸收。
牛奶具催眠鎮靜作用，而早晨正是人們精力充沛投入學習工作的時段。飲用牛奶易引發睡意，將影響學習與工作效率，故應避免於早餐前空腹飲用。
那麼，飲用牛奶的最佳時機為何？夜間飲用被認為最為理想。牛奶含有誘發疲勞感與睡意的生化物質L-色胺酸，以及微量類嗎啡物質，這些成分具有一定鎮靜催眠效果。其中L-色胺酸更是腦內合成血清素的主要原料，而血清素對大腦睡眠機能至關重要。此作用能暫時抑制腦部思考活動，促進睡眠需求。且無副作用之虞。牛奶能附著於胃壁易於吸收，其中鈣質更具舒緩緊張之效。故對長者睡眠尤具裨益，夜間飲用牛奶有助提升休憩與睡眠品質。
睡前飲用牛奶可促進鈣質吸收。晚餐攝取之鈣質多數將於就寢前於體內吸收。入睡後，尤其午夜12時過後，血鈣濃度會逐漸下降。血鈣減少會促使副甲狀腺分泌亢進，其分泌的激素作用於骨組織，溶解部分骨鈣鹽並吸收到血液中，以維持血鈣穩定平衡。此溶解作用雖屬人體自調機能，但長期持續將成為骨質疏鬆症的成因之一。睡前飲用牛奶時，牛奶中的鈣質會緩慢被血液吸收，使整夜的血鈣濃度得以補充與維持，無需從骨骼溶出鈣質，從而預防骨量流失與骨質疏鬆症。因此睡前攝取牛奶具有保健效益。