Embora a natação não desenvolva músculos volumosos e salientes, ela aumenta a força e a coordenação de vários grupos musculares, especialmente os do tronco, cintura escapular e membros superiores. A natação exige superar uma resistência significativa na água e é um movimento cíclico. A prática regular melhora a força muscular, a velocidade, a resistência e a flexibilidade das articulações.
Outro benefício significativo da natação é o aumento da flexibilidade. Isto permite que as pessoas continuem a nadar mesmo quando limitações relacionadas com a idade impedem a prática de outros desportos. A ampla amplitude de movimentos necessária na natação faz com que os nadadores regulares se tornem cada vez mais flexíveis e ágeis. Além disso, a técnica adequada de natação requer o alongamento muscular antes da contração, um padrão de movimento que contribui para melhorar progressivamente a flexibilidade e a força.Mecanismos de termorregulação aprimorados Como a temperatura da água normalmente fica abaixo da temperatura do ar ambiente e possui uma condutividade térmica dezenas de vezes maior do que o ar, a taxa de dissipação de calor na água excede em muito a do ar. A natação regular melhora a capacidade de termorregulação do corpo, aumentando assim a tolerância às flutuações de temperatura externas. A natação no inverno, em particular, demonstra benefícios especialmente pronunciados nesse aspecto.