（1）用藥前須實施嚴格篩檢，包含病史詢問、全身檢查及婦科檢查，並進行尿液妊娠試驗、陰道環境評估、滴蟲與念珠菌檢測、血液常規檢查、血型鑑定等臨床檢驗，必要時輔以超音波檢查。
（2）醫師須詳細說明服藥方式、藥效及潛在副作用，取得同意後方可給藥。
（3）現行常用劑量：米非司酮150～200mg單次服用，或分三日服用。第三日於醫院追加前列腺素製劑：卡普司酮1mg陰道給藥，或米索前列醇600μg口服，並進行6小時院內觀察。
（4）流產過程監測：住院觀察期間除監測血壓、脈搏及藥物副作用外，須將排泄之尿液與糞便儲存於清潔便器中，由負責人員檢查並記錄胎囊有無、排出時間、胎囊大小及出血量。若胎囊排出前後出現活動性出血，應施予子宮收縮劑或立即施行刮宮術止血。
（5）若6小時後胎囊未排出且出血量少，可返家休養。須遵照醫師指示回診。若在家排出組織，應攜至診所請醫師確認。藥物流產通常需時3至4日，服藥期為4天。空腹狀態下，第1至3日早晚各服1錠，第4日一次服用3錠。通常前三日幾乎無自覺症狀，第四日服藥後會產生劇烈疼痛，但亦有反應輕微者。
藥物流產不僅耗時，術後約需兩週靜養。請密切觀察陰道出血量，若出血量超過月經量或伴隨其他不適症狀，為避免健康問題請立即就醫。