1. Pred formalno amniocentezo zdravnik opravi ultrazvočni pregled, da ugotovi velikost ploda, gestacijsko starost, položaj ploda in število plodov.
2. Pod ultrazvočno kontrolo poiščite optimalno mesto za vstavitev.
3. Razkužite kožo matere.
4. Na trebuh matere položite sterilno krpo.
5. Pod ultrazvočno kontrolo se v vnaprej izbrano amniotično votlino postopoma vstavi 20- ali 22-gauge spinalna igla;
6. Ko se potrdi, da je igla v amniotični votlini, se amniotična tekočina aspirira z negativnim tlakom;
7. Prva 2 mililitra tekočine je treba zavreči (da se prepreči kontaminacija z materinimi celicami);
8. Izvleče se približno 20 mililitrov amniotske tekočine.
9. Notranja kanila igle se zamenja.
10. Celotna igla se izvleče.
11. Na mesto vbodne rane na trebuhu nosečnice se namesti obliž. Nosečnica naj 10 minut počiva zunaj sobe za amniocentezo. Če ne čuti nelagodja, se lahko vrne domov in počaka na rezultate.