1. Vpliv na zobno pulpo: V začetnih fazah ortodontskega zdravljenja lahko pride do blagih vnetnih reakcij v zobni pulpi. Pacienti lahko v dneh po uporabi sile ortodontskega aparata občutijo bolečino ali nelagodje. Ta vidik ortodontskega zdravljenja ne škoduje zobem.
2. Gibljivost zob: V normalnih okoliščinah ima vsak zob določeno stopnjo fiziološke gibljivosti, ki blaži pritisk pri žvečenju in preprečuje poškodbe. Med ortodontskim zdravljenjem je povečana gibljivost zob naravna reakcija.
3. Učinki na zobne korenine: Med ortodontskim zdravljenjem pride na površini zobnih korenin do resorpcije in hiperplazije kot del procesa preoblikovanja. Po zdravljenju se korenine vrnejo v normalno stanje zaradi svoje lastne sposobnosti regeneracije.
4. Vpliv na višino alveolarnega kosti: Pri osebah, ki so se podvrgle ortodontskemu zdravljenju, lahko pride do rahlega zmanjšanja višine alveolarnega kosti. To je v prvi vrsti posledica nezadostne ustne higiene med zdravljenjem. Po končanem ortodontskem zdravljenju se resorpcija alveolarnega kosti ustavi in se postopoma vrne v normalno stanje.