眉毛刺青或許是多數人接觸最早的美容整形項目……許多人未將其視為整形手術，認為眉毛刺青簡單安全，修整眉型即可變美，因而較少顧慮風險。然而實際上，眉毛刺青同樣屬於美容整形範疇，雖流程不複雜，仍可能引發以下副作用：
局部感染
施術前消毒或施術中滅菌操作不當、未遵守無菌操作程序；患者術後疏於護理亦可能引發感染。
交叉感染
肝炎、愛滋病等病毒可透過血液、淚液、唾液傳播，稍有疏忽便可能引發醫療相關交叉感染。主要成因在於刺青針消毒不徹底且多人共用，尤其缺乏醫學知識者從事眉部刺青施術時，甚至可能完全不進行針具消毒。部分美容師僅採用傳統酒精或苯扎氯銨（新潔爾滅）消毒。此類消毒劑無法殺滅B型肝炎病毒及HIV，故可能引發交叉感染。
眉色與眼線瑕疵・褪色問題
因左右眉形或眼線不對稱，可能形成各種不自然的眉型與眼線。
眼球損傷