Клінічне застосування показує, що високі дози вітаміну В2 демонструють вищу ефективність, ніж загальновживаний препарат від мігрені флунаризин гідрохлорид, при цьому мають менше побічних ефектів і нижчу вартість. Терапевтичний ефект вітаміну В2 може бути пов'язаний з підвищенням енергетичного потенціалу мітохондрій клітин. При застосуванні вітаміну В2 для профілактики та лікування мігрені він виявляється найбільш ефективним для пацієнтів із помірною формою захворювання, які страждають лише від декількох нападів на місяць, при цьому оптимальні терапевтичні результати зазвичай досягаються після трьох місяців прийому.Рекомендована добова доза вітаміну В2 зазвичай становить близько 400 міліграмів.