Klinisk tillämpning visar att höga doser av vitamin B2 har bättre effekt än det vanligt förekommande migränläkemedlet flunarizinhydroklorid, med färre biverkningar och lägre kostnad. Den terapeutiska effekten av vitamin B2 kan bero på att det ökar cellernas mitokondriella energipotential. När vitamin B2 används för förebyggande och behandling av migrän är det mest effektivt för personer med måttliga besvär som endast har några få anfall per månad, och optimala terapeutiska resultat uppnås vanligtvis efter tre månaders administrering.Den rekommenderade dagliga dosen av vitamin B2 är i allmänhet cirka 400 milligram.