Klinična uporaba kaže, da visoki odmerki vitamina B2 kažejo večjo učinkovitost kot pogosto uporabljeno zdravilo proti migreni flunarizin hidroklorid, pri čemer imajo manj stranskih učinkov in so cenejši. Terapevtski učinek vitamina B2 lahko izhaja iz njegovega povečanja energijskega potenciala celičnih mitohondrijev. Pri uporabi vitamina B2 za preprečevanje in zdravljenje migrene se je izkazal za najbolj učinkovitega pri zmernih bolnikih, ki imajo le nekaj napadov na mesec, pri čemer se optimalni terapevtski rezultati običajno dosežejo po treh mesecih jemanja.Priporočeni dnevni odmerek vitamina B2 je običajno okoli 400 miligramov.