Zastosowanie kliniczne wskazuje, że wysokie dawki witaminy B2 wykazują lepszą skuteczność niż powszechnie stosowany lek przeciwmigrenowy, chlorowodorek flunaryzyny, przy mniejszych skutkach ubocznych i niższych kosztach. Działanie terapeutyczne witaminy B2 może wynikać z jej wzmacniającego wpływu na potencjał energetyczny mitochondriów komórkowych. W przypadku stosowania witaminy B2 w profilaktyce i leczeniu migreny, okazuje się ona najbardziej skuteczna u osób cierpiących na umiarkowaną postać choroby, doświadczających tylko kilku ataków miesięcznie, a optymalne wyniki osiąga się zazwyczaj po trzech miesiącach leczenia.Zalecana dzienna dawka witaminy B2 wynosi zazwyczaj około 400 miligramów.