Klinisk anvendelse indikerer at høye doser vitamin B2 har overlegen effekt sammenlignet med det vanlige migrenemedikamentet flunarizinhydroklorid, med færre bivirkninger og lavere kostnader. Den terapeutiske effekten av vitamin B2 kan skyldes at det forbedrer cellenes mitokondrielle energipotensial. Når vitamin B2 brukes til forebygging og behandling av migrene, viser det seg å være mest effektivt for moderate pasienter som bare har noen få anfall per måned, med optimale terapeutiske resultater som vanligvis oppnås etter tre måneders administrering.Den anbefalte daglige dosen av vitamin B2 er vanligvis rundt 400 milligram.