色素沉澱多因抽脂範圍過廣或深度過深導致皮膚缺血，尤好發於小腿及腹部。通常術後半年左右色素沉澱會自然消退，但頑固性沉澱僅能透過化學或物理療法改善。極少數案例術後可能出現色素脫失，此為較難處理的併發症。頑固性形體不整：由過度抽吸或抽吸層次範圍不均勻所致，前述含笑女士案例即屬此類。小範圍凹凸可透過自体脂肪移植修正，但大範圍凹凸則需二次抽脂調整。左右不對稱：主要因抽脂導管粗細不一致所致，僅能藉由二次抽脂修正。併發症以患者自述為主，包含慢性硬變、慢性疼痛及持續性感覺異常。
慢性硬變：因術後早期炎症引發生理功能障礙、水腫及細胞炎症導致硬化，易於抽脂後一年內發生。皮膚循環障礙亦為成因，主要症狀為皮膚光澤喪失、硬結及彈性下降。可透過超音波按摩或運動療法改善。
慢性疼痛：肇因於手術操作粗暴、切口設計不當或皮下瘢痕增生。主要症狀為放射性疼痛，夜間尤為明顯。發生時需遵醫囑併用局部阻斷麻醉、瘢痕切除術或鬆弛術等治療。
持續性感覺異常：此類脂肪抽吸後局部變化多見於合併皮膚切除的手術，亦罕見於過度抽脂或抽脂層過薄之案例。
吸脂術後早期併發症亦包含血清腫與肌損傷症候群。
血清腫及血腫主要因術後壓迫不足、壓迫材料移位或引流不暢所致。發生時需重新進行引流並重新施加壓迫繃帶。
肌損傷症候群係因吸脂手術損傷深層筋膜下肌層（尤見於小腿），導致肌纖維斷裂與出血。積聚的血腫使筋膜腔內壓力升高，壓迫神經血管而引發神經肌肉功能障礙，進而產生劇烈疼痛與運動功能受限。此併發症多源於醫師經驗不足或操作粗糙，一旦發生須立即接受專業醫療處置。
除上述併發症外，抽脂手術亦可能引發嚴重併發症。文獻曾記載因出血性休克、脂肪栓塞、腹壁穿孔導致腸道破裂等致死案例，然此類情況屬罕見。
綜上所述，脂肪抽吸減重可能衍生諸多問題，多數併發症皆源於施術者操作所致。然而若選擇正規醫療機構與優秀整形外科醫師，既能將併發症發生率降至最低，亦可獲得令人滿意的抽脂效果。因此在決策時務必審慎選擇。